為了尋求更好的出路，幾經(jīng)打聽，他得知明軍成都步兵營招收童子軍，便報考了童子軍。說來也是巧了，在劉顯報考的那天晚上，當時駐軍成都的四川衛(wèi)使劉岷夜里做夢時，忽然看見了一只大黑虎朝著他軍營的官邸跑了進來。

后，出于文貴武賤的習慣心態(tài)，奪去了劉顯薪俸，交都察院核查，坐以劉顯瀆職罪名，第一次被革職。

嘉靖四十一年五月，廣東沿海一帶的倭寇又蜂擁而起。此時嘉靖國亂思良將，又急詔起用劉顯任總兵官，鎮(zhèn)守廣東、福建一帶海域軍事防守。

適逢福建沿海又爆發(fā)了倭寇進犯侵擾，地方官府和駐防部隊對這突如其來的倭寇都感到十分棘手，無法對付。劉顯得到軍報傳令，火速率領大軍趕赴增援。并與時任浙江都司僉事、參將戚繼光一起協(xié)同作戰(zhàn)，連續(xù)擊敗倭寇，并直接拔了倭寇的大本營，但凡進入福建沿海境內(nèi)的倭寇無有幸存，全部消滅干凈。

然而，賊心不死的倭寇又源源不斷地大批涌竄至應天境內(nèi)，并迅速攻下了興化城。劉顯所部當時因連續(xù)轉戰(zhàn)，兵力大減，與占據(jù)興化的倭寇主力兵力懸殊，于是只好圍而不攻，不敢冒昧開戰(zhàn)。

結果沒的說，劉顯馬上被再次彈劾，說他征剿倭寇不力。參劾上去后，嘉靖考慮到國家正值多事之秋，正是用人之際，不能自剪羽翼，于是下詔命令劉顯戴罪立功。

此時倭寇又不斷地攻奪重要海岸據(jù)點，在平海衛(wèi)附近與明軍形成了拉鋸戰(zhàn)。而打劫福建福清的另一支倭寇，也打算與平海衛(wèi)的倭寇聯(lián)手。好在倭寇的圖謀被劉顯識破，劉顯遂與福建總兵官俞大猷合兵于遮浪半島，將盤踞在遮浪的倭寇全部消滅干凈。平海衛(wèi)的倭寇聞訊打算逃跑，卻被把總許朝光攔截打敗，并將倭寇船只全部燒光。

這時戚繼光也率領所部前來增援，與劉顯、俞大猷三部平倭主力大會師，一同合力作戰(zhàn)，將興化一帶的倭寇全部殲滅，收復了失陷的興化城。

由于劉顯在這一場殲滅廣東、福建一帶倭寇的戰(zhàn)役中功勛顯著，朝廷論功行賞，在他原有正三品都指揮僉事的級別上晉升兩級，為正二品的都督僉事。此時，江北的揚州、淮安、泰州、南通等地的倭寇尚未完全殲滅平定，朝廷決定設總兵官于狼山，統(tǒng)制大江南北，劉顯改任總兵官駐軍狼山。

到任后，總兵劉顯為履行行部考核地方官員的職責，要求皇帝能下一道諭旨給他，以便好節(jié)制知府以下這些地方官員。由于通州同知王汝對劉顯心生妒嫉——劉顯部駐扎通州附近，而王汝為文官，不肯被劉顯節(jié)制——于是上書彈劾劉顯，指責劉顯的請求是對皇帝的不恭，是非分要求……于是劉顯被降職處分。

沒多久嘉靖帝駕崩，隆慶帝登基。此時的劉顯已經(jīng)吃夠了文官的苦頭，不敢再跟文官作對，但他沒料到在南京附近為將，不僅不能跟文官頂牛，還要聽南京守備勛臣招呼(無風注：南京其實才是大明正式首都，也有六部等留守機構，但多為虛設，南京真正的三大實權巨頭為：南京兵部尚書、南京鎮(zhèn)守太監(jiān)、南京守備勛臣。這也是歷史上崇禎自殺后，南明朝廷一時之間以時任南京兵部尚書史可法為首的主要原因。)，劉顯因為身為武將卻不知進獻，被南京守備勛臣打壓，非說他屬下兵丁數(shù)目與在籍人數(shù)相差甚大，結果劉顯就再次被“革職候勘”了。

劉顯說到此處，臉上全是憤怒：“高公子，要說衛(wèi)所兵丁人數(shù)與在籍人數(shù)不符，我大明數(shù)百鎮(zhèn)，哪一鎮(zhèn)能符？南京諸鎮(zhèn)兵員與在籍人數(shù)相差之大，比我劉某人手下相差可大得多了，這些人何不自請?zhí)幏郑珌碚f我？”

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